Bioinformatiker i RNA-seq baserade uttrycksanalyser i Uppsala

Om tjänsten

Publicerad: 2019-09-12

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 44.000 studenter, 7.100 anställda och en omsättning på 7 miljarder kronor.

National Bioinformatics Infrastructure Sweden, NBIS () främjar svensk livsvetenskaplig forskning genom att tillhandahålla bioinformatisk expertis och programmeringskompetens till forskare. Över 60 experter finns anställda vid de större universiteten i Sverige där de bidrar med spetskompetens inom ett flertal områden som genomik, transkriptomik, proteomik, metabolomik och statistik. NBIS utgör också bioinformatikplattformen på SciLifeLab (), en nationell resurs som tillhandahåller avancerade storskaliga tekniker och kunnande inom biovetenskaperna. Genom nära samarbete med de dataproducerande faciliteterna och med ledande forskargrupper har NBIS enastående möjligheter att erbjuda bioinformatiska analyser av högsta klass.

NBIS söker nu en ny medarbetare som ska stödja svenska forskare med sekvens-baserad bioinformatik. Positionen är placerad vid Uppsala Universitet i Navet, SciLifeLabs Uppsala-nod. I denna kreativa miljö finns över 30 bioinformatiker, flera core-faciliteter och många olika forskargrupper representerade. Navet är en perfekt plats för bioinformatiker som vill öka sina kunskaper, med många kunniga kollegor att diskutera med och kurser och seminarier regelbundet tillgängliga.

Arbetsbeskrivning: Arbetet kommer att fokusera på betald bioinformatisk support till svenska forskare. Arbetsuppgifter kommer att inkludera analyser av uttrycksdata (RNA-seq), men kan också beroende på sökandes kompetens inkludera annan sekvensbaserad bioinformatik, eller programmering. Ansvarsområden inkluderar analyser av data, kundkommunikation, eget lärande om nya metoder, rapportskrivande och undervisning.

Kvalifikationskrav: Vi söker en bioinformatiker med gedigen erfarenhet av sekvens-baserad bioinformatik, framförallt inom RNA-seq baserade uttrycksstudier. Erfarenhet av single-cell RNA-seq ses som extra positivt. Goda kunskaper i R är nödvändigt, likaså god förmåga att arbeta i terminalbaserad Linux-miljö. Vidare krävs god förmåga att arbeta i en serviceinriktad miljö, både i samarbete och självständigt. Utmärkt talad och skriven engelska krävs. Utmärkt kommunikationsförmåga är nödvändigt, eftersom innehavaren av denna tjänst kommer att samarbeta med forskare från mycket olika bakgrund. Stor vikt kommer läggas vid personlig lämplighet såsom flexibilitet, kunna hantera arbetstoppar, förmåga att både samarbeta och arbeta självständigt.

Önskvärt/meriterande: En doktorstitel i bioinformatik, molekylärbiologi, datavetenskap eller liknande är meriterande, men personlig lämplighet och erfarenhet av RNA-seq baserade uttrycksstudier rankas högre. Kunskap i ett eller flera skriptspråk (python/perl) ses som positivt.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: Snarast.

Anställningsform: Tillsvidare. 6 månader provanställning tillämpas.

Anställningens omfattning: 100 %.

Upplysningar: För allmänna frågor om NBIS, kontakta Professor Bengt Persson, bengt.persson@nbis.se. För mer specifika frågor om arbetsuppgifter kontakta Dr. Henrik Lantz, henrik.lantz@nbis.se.

Välkommen med din ansökan senast den 14 oktober 2019, UFV-PA 2019/2896.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Extra information

Status

Stängd

Ort

Uppsala

Typ av kontrakt

Deltidsjobb

Typ av jobb

Kontor / Administration

Körkort önskas

Nej

Tillgång till bil önskas

Nej

Personligt brev krävs

Nej